(一)缺乏有效的税务筹划和风险控制机制

    在税收管理方面，建立一套行之有效的税收筹划与风险管控机制，是保证企业合法经营、降低税收成本的关键。但是，对于很多企业来说，这项工作尚是一个很大的挑战。企业因为不能及时掌握税法及相关政策的变动，错过了最佳节税时机，或是因为不熟悉新税法，而面临合规风险。企业在进行税务筹划决策时，常常只注重眼前的收益，而忽略了长远的税务风险，从而使企业在面临税法审核与税务政策变动的时候显得十分被动。由于缺乏有效的风险管控机制，企业对税收风险的识别、评估与应对能力不足。若缺乏系统性的风险管理架构，企业就不能及早侦测到可能发生之税收间题，或未能在间题发生时加以补救，结果可能造成财务损失或名誉受损。                  

    (二)税务筹划与企业战略脱节导致资源浪费

    目前，我国企业税务筹划工作普遍存在的一个间题就是没有将税务筹划与公司总体战略有机地结合起来。企业在制定税收策略时，常常忽略了与企业长远发展目标相协调的间题，从而造成了税收筹划与公司核心业务发展不相协调，造成了资源的浪费。比如，部分企业为了享受短期减税政策而在某些区域设立分行，却没有考虑到该区域的潜在市场和长远的投资收益，从而造成了资源的低效使用。另外，税收筹划决策中缺少多个部门间的交流与协作，使得税收筹划很难与其他管理领域如财务、经营等产生协同作用，导致资源分配不合理。

    (三)税务信息化建设滞后影响决策效率

    在信息化的背景下，税收信息化已经成为企业税收管理工作的重要组成部分。但是，目前我国很多企业的税收信息化建设还存在一定的差距。具体来说，就是税收信息处理系统的不完善，不能及时地对数据进行科学有效地分析;税务信息分享机制不健全，使得政策制定者很难得到完整、精确的税务信息;税收管理系统的升级与更新非常缓慢，不能满足不断变化的税收法律法规和商业需要。上述间题既影响了纳税筹划的精度与时效性，也使企业在税务稽查、应对稽查等方面面临着更大的负担，从而降低了税务行政工作的总体效率。