科研事业单位的税务筹划与其他企业的税务筹划都属于一种合理避税行为，但由于受传统体制影响较大，其管理机制相对复杂，必须加强内部控制，确保税务筹划有效实施。          

    首先，科研事业单位应建立科学合理的内部控制制度，明确单位内部各部门在税务筹划中的责任，以保障税务筹划顺利实施。对于科研事业单位来说，财务人员是进行税务筹划的直接责任人，负责税务筹划方案的制定与实施;其他部门则负责配合财务部门进行税务筹划。各部门之间应加强沟通，配合默契、协作有序，从而降低风险。

    其次，注重事前准备。在制定税务筹划方案前，各部门应对相关政策进行认真研究分析并提出可行性建议。科研事业单位应事先明确国家相关政策和法规的具体要求以及享受优惠政策的条件并准备好相应的材料。相关工作必须在单位内部组织实施前完成，以免因人员变动或其他因素而影响税务筹划效果。

    再次，强化事后监督。由于税务筹划涉及多个部门和人员，且需要较长时间的执行和完善，所以各部门应加强监督与控制，在制定方案时要进行充分的风险评估;在实际执行过程中要定期对税务筹划方案进行检查和评估;在完成目标后还要定期对所取得的成果进行总结和分析。

    最后，完善绩效考核制度。科研事业单位应建立有效的绩效考核制度及奖惩制度，将税务筹划工作纳入考核内容。具体而言，科研事业单位可根据工作目标和实际情况将税务筹划工作纳入日常工作考核中，对表现突出者给予奖励;对表现较差者则给予适当批评教育等。完善绩效考核制度不仅可以提高单位整体的工作效率、实现经济效益最大化目标，而且能够让每个职工意识到自身在税务筹划中的重要性。