1、税收征管与会计核算管理步调不一致

      《企业会计准则》和《企业财务通则》规定的核算内容与新税制的要求不是完全吻合。会计利润与应税所得的差异项目过多的事实，也使企业所得税年末汇算清缴工作时间短、任务重、难度大，极其复杂繁琐，给税务部门造成了很大压力，也提高了所得税征收成本。而作为理性经济人的企业在与税务部门的博弈中利用各种差异项目千方百计进行偷税、逃税、避税，也令税务部门防不胜防，十分棘手。             

    2、缺乏统一规范的核算文本

    现行的会计制度是先于税制改革制定的，对税收会计核算要求只在“应交税金”科目下进行了简单的介绍。而相继颁布的新税种，又只是各个税种相互独立地列明会计处理方法。企业会议人员难以从统一的文本中系统了解和掌握税收会计核算方法。在税款计缴过程中，难免顾此失彼。

    3、税务机关对会计核算人员缺乏有效的监督

    目前会计人员的管理方式是统一由各级财政部门培训、发证及考核。税务机关对会计核算工作缺乏硬性监督。只有一般性的税法宣传和公示公告，无法使企业会计人员系统掌握税收会计核算方法。

    4、税法对财务制度的强化与税收宏观调控功能不匹配

    我国已经取消了统一的企业财务制度，而企业所得税法规定的税前准予扣除的项目中处处可见统一的企业财务制度的影踪，过多过细的对企业费用列支标准的规定往往事与愿违，并不能保障这一功勇的顺利实现，与税收宏观调控的功能不匹配。